技术平台

抗逆改良中心
当前位置: 首页 > 技术平台 > 抗逆改良中心 > 正文

生物信息学平台

中心建立了高性能计算服务器平台,由一台登录管理节点(IBM  X3650M5 机架式服务器)、14台刀片节点(64GB内存/台)、2台机架计算节点(512GB内存/台)、2台四路大内存节点(3TB内存/台)、348TB存储(存储速度为2.5GB/秒)构成。计算能力理论值15.7万亿次每秒。刀片计算系统、大内存节点、管理登录节点采用线速互连的56Gb FDR InfiniBand计算网络;监控管理网络采用千兆交换方案。

配备多个序列数据库和Perl、R、Python、matlab、JAVA、C语言等开发语言环境,形成了以高性能计算、高通量基因组学数据分析、序列拼接、表观遗传学、基因芯片分析、小RNA分析、转录组分析、单细胞数据分析为核心的分析路线和体系。

已搭建基本生物学数据分析常用软件,用户也可根据需要自行安装。

平台能够广泛应用于SNP 检测、基因表达分析、全基因组关联分析(GWAS)、连锁分析、QTL定位、基因组组装、基因组注释、基因功能分析、代谢途径分析、比较基因组分析、进化分析、靶基因预测等多种基因组学分析工作。


Copyright@2017 作物逆境适应与改良国家重点实验室  All Rights reserved

地址:中国-河南-开封 联系电话:0371 — 23798708