孙旭武利用单细胞转录组解析拟南芥幼苗叶脉发育早期细胞转录组图谱方面取得新进展

在叶片和子叶中，叶脉模式的形成是通过将基础细胞逐渐招募到原形成层细胞中实现的。种子萌发后，子叶快速发育产生叶绿体，并通过光合作用为幼苗的生长和存活提供能量。随着子叶的发育，在子叶中的叶脉快速出现。它们构成了幼苗中光合产物和矿物质运输的关键通道网络。尽管已有大量的研究试图解析在幼苗发育早期子叶中叶脉的发育调控机制，但由于组织分离技术的局限性，至今仍然难以完全理解。最近，single cell RNA-Seq (scRNA-seq) 技术已经在解析植物气孔的发育和根系的发育中得到了快速的应用，并且在解析成熟叶片的韧皮薄壁组织的发育和功能中得到了应用。但是关于幼苗生长初期，在单细胞转录组层面关于子叶中的叶脉的发育调控机制的研究还未见报道。

该研究系统地分析了拟南芥幼苗生长初期子叶叶脉的单细胞转录组图谱，鉴定了关键的标记基因，并构建了特定细胞类型的转录调控网络。本研究结果为研究子叶叶脉的早期转录组图谱提供了新的见解，并有助于识别叶脉细胞的新标记基因。这些新标记基因的动态表达模式通过GUS报告融合进一步得到证实，为叶脉发育的机制提供了新的信息。在未来的研究中使用这些新标记，可以更完整地了解叶脉发育的机制。

2022年3月16日，该研究结果以Identification of Novel Regulators Required for Early Development of Vein Pattern in the Cotyledons by Single-cell RNA-seq为题发表在Plant Journal杂志上（论文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35218590/）。