宋纯鹏课题组在拟南芥编码和非编码RNA假尿苷修饰方面取得新进展

假尿苷（pseudouridylation，Ψ）是尿苷（U）的异构化产物，广泛存在于酵母及哺乳动物的mRNA及多种非编码RNA中。但植物RNA，尤其是mRNA是否也存在Ψs尚不清楚。

通过全转录组假尿苷测序，我们首次在拟南芥mRNA中鉴定到几百个Ψ位点，同时也检测到了其他非编码RNA中的多个Ψ位点。本课题组研究表明，假尿苷修饰广泛分布于mRNA中，但在3'非翻译区Ψ位点较少，而在三联体密码子的第一位分布多。苯丙氨酸密码子UUC是Ψ修饰频率最高的密码子。与野生型相比，叶绿体假尿嘧啶合酶基因SVR1 (Suppressor of variegation 1) 突变体中，叶绿体23S、16S和4.5S rRNA中的Ψ修饰减少；并且，突变体中多个质体核糖体蛋白和光合作用相关蛋白水平显著下降。这些结果表明SVR1在拟南芥叶绿体蛋白合成中起重要作用。我们的研究结果填补了植物RNA中假尿苷修饰研究的空白，为植物RNAs的假尿苷图谱构建及其功能研究奠定了基础。

2019年10月15日，上述研究结果”Transcriptome-wide analysis of pseudouridylation of mRNA and non-coding RNAs in Arabidopsis”为题发表在Journal of Experimental Botany 杂志上。

拟南芥mRNA转录本及密码子中Ψ的分布统计