宋纯鹏教授课题组在植物RNA表观遗传修饰研究方面取得进展

2019年6月6日，Journal of Experimental Botany在线发表了植物逆境生物学重点实验室宋纯鹏教授为通讯作者的研究论文“Transcriptome-wide analysis of pseudouridylation of mRNA and non-coding RNAs in Arabidopsis”。

假尿苷修饰（pseudouridylation，Ψ）广泛存在于酵母及哺乳动物的mRNA及多种非编码RNA中，Ψ是尿苷（U）的异构化产物。然而，关于RNA特别是植物mRNA中的Ψs仍知之甚少。该研究通过假尿苷测序，首次在拟南芥mRNA中鉴定到Ψ位点，同时检测到了其他非编码RNA中的Ψ位点。研究发现，三联体密码子第一位的U更容易被假尿苷化；位于mRNA 3'非编码区的U与5'非编码区和编码区的U相比有较少的异构化修饰；编码苯丙氨酸的密码子UUC最容易被假尿苷化；假尿嘧啶合酶SVR1基因缺失会导致叶绿体23S、16S和4.5S rRNA中一些Ψ修饰的减少，突变体中许多质体核糖体蛋白和光合作用相关蛋白显著减少。

该研究结果为拟南芥RNAs的假尿苷图谱和SVR1的生物学功能提供了新的见解，将为进一步利用Ψ修饰以调控植物基因表达和蛋白质生物合成奠定了基础。

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https://academic.oup.com/jxb/advance-article/doi/10.1093/jxb/erz273/5512449